बुनियादी जैविक असंगतियों के कारण, बाँझ संकर (वे जीवित युवा पैदा करने में असमर्थ) जैसे खच्चर (एक घास और एक घोड़ी के बीच एक संकर) आमतौर पर प्रजातियों के बीच क्रॉस से उत्पन्न होते हैं। कुछ अन्तर्विषयक संकर, हालांकि, उपजाऊ और सच्चे प्रजनन हैं। ये संकर नई प्रजातियों के निर्माण के स्रोत हो सकते हैं। कई आर्थिक या सौंदर्य संबंधी महत्वपूर्ण पौधों (केले, कॉफी, मूंगफली, डहलिया, गुलाब, ब्रेड व्हाट्स, अल्फाल्फा, इत्यादि) की उत्पत्ति प्राकृतिक संकरण या रासायनिक साधनों, तापमान परिवर्तन या विकिरण से प्रेरित संकरण के माध्यम से हुई है।
संकरण की प्रक्रिया जैविक रूप से महत्वपूर्ण है क्योंकि यह एक प्रजाति के भीतर आनुवंशिक विविधता (विभिन्न जीन संयोजनों की संख्या) को बढ़ाती है, जो विकास के लिए आवश्यक है। यदि जलवायु या निवास स्थान की स्थिति बदलती है, तो कुछ संयोजनों वाले व्यक्तियों को समाप्त किया जा सकता है, लेकिन विभिन्न संयोजनों वाले अन्य लोग बच जाएंगे। इस तरह, किसी प्रजाति की उपस्थिति या व्यवहार को धीरे-धीरे बदल दिया जा सकता है। इस तरह के प्राकृतिक संकरण, जो कुछ प्रजातियों के बीच व्यापक है, प्रजातियों की पहचान और गणना को बहुत मुश्किल बना देता है।
