कई बैक्टीरिया हैं जो रोगजनक हैं और पौधों, जानवरों और मनुष्यों में रोग पैदा करते हैं; इस प्रकार इन रोगजनक बैक्टीरिया की क्षमता के विकास, प्रसार और बीमारी को रोकने की आवश्यकता है।
यह एंटीबायोटिक दवाओं और एंटी-बैक्टीरियल दवाओं के उपयोग से प्राप्त किया जाता है। ये दवाएं बैक्टीरिया कोशिका के भीतर महत्वपूर्ण कार्यों को मार देती हैं या धीमा कर देती हैं और इस प्रकार उन्हें तेजी से गुणा करने और बीमारियों का कारण बनने से रोकती हैं।
इसके अलावा इन रोगजनक बैक्टीरिया के कारण होने वाले रोगों को टीके के प्रशासन द्वारा रोका जा सकता है।